病院向けシステムについて

業界は異なりますが、エステサロンで似たような要件に対して「Salesforce」を使った提案を行ったことがあります。その時は初期費用100万前後、月額数十万という見積だったと記憶しています。利用するユーザ数がかなり多かったため、それが月額費用に跳ね返ったかたちです。
＃フルスクラッチ(イチから作る)の見積も一応作ったのですが、開発費用だけで1,000万を超えました。
＃低予算を希望されていたのでこの見積は即時却下されましたが(笑)

また、バーコードの読み取り(機能)は、PCに直接つなぐタイプの機器であれば開発費用が少額で済みますが、ハンディタイプを使うと結構高くなります。出力部分を含めて最低(直接つなぐ方式で)10万、と言ったところでしょうか。

いずれにせよ、要件次第というところが大きいですが、貴医院の要件そのものズバリのパッケージが無い限りは初期開発費用は100万を越えるような感覚があります。利用場所が1拠点で1台のPC、または社内ネットワーク内で完結するなら、「Access」や「FileMaker」等でフルスクラッチ、という手もありそうですが、これでも50万前後の見積かな、と。

補助金については国・地方公共団体等でシステム開発に関する制度があれば利用できると思うのですが、そのあたり不勉強なので可否に関しては分からないです。ただ、基本は開発費用に対して補助が出ると思いますので、月額費用や保守費用等、いわゆる「運用コスト」については適用されないというのが一般的かと思います(初年度費用とかで一括で支払えば1年分はもしかすると補助の対象になるかも。制度次第です)。

以前　ホワイトニング　歯科医院の予約　と簡単な施術　売上管理の仕組みを構築しました。
おそらくそれと、同じような形で制作できると思います。

予約・施術・売上　で　200－300万円程度
薬品　管理は　70－10０万程度でしょうか？

もちろん、いずれも仕様次第で、見積もりが変わってしまいますが、
一応の参考にしてください。