納品ファイル複数での注文ができますか？

クライアント（発注者）がデータ確認の作業を完了する前であれば、複数のファイルを納品することが可能です。
「データ納品」のボタンより複数回に分けてファイルを納品してください。

↑らしいですよ。m(__)m

山本雪様がお答え頂いている方法もありますが、たくさんある場合や容量が大きい場合には「宅ファイル便」などの無料ストレージサービスを利用されることもご検討頂ければと思います。（PSD納品のお客様もいらっしゃいますので）

納品用ファイルの場合は、どの形式でも可能です。
但し、ファイルサイズは上限がありますので気をつけてください。

サイズが明らかに大きい場合は、白河弥生様がアドバイスされているように
ストレージサービスを利用される事をおすすめします

さらに言うなら、パスワード付きのZIPファイル等で圧縮した物を受け渡しに利用するのがおすすめです。

はじめまして。
今、募集しているロゴマークの案件でしょうか？
その後の利用や展開を考えると、illustrator（Ai）でも納品してもらったほうが絶対に良いです。
ロゴでしたら、ファイル形式を複数にしても100MBを超えるような事はまず無いです。

まだ募集中でしたら、追記で「納品はイラストレーター（Ai）も必要」と、加えた方が良いと思います。
おそらく、ほとんどのデザイナーの方がillustratorで作成していると思われますので、問題ないと思いますが
たまに他のソフトで作成している方もおられますので、追記の告知は早めにしたほう良いと思います。