報酬申請について

おはようございます。
出金方式を変更するページをご覧になってのご質問だと思いますが、
それ（随時または5万円以上）以外の方法はキャリーオーバーだけですね。
5万円以上出金方式以外の金額を指定して出金する場合は、クイック出金がありますが手数料が高いですね。

出金期限についても書いてあるとおり解釈すれば、あなた様の理解で正しいと思います。

>金額の設定を1万円、3万円にできないのでしょうか。

そのようにしたいところですが、残念ながら、そういった設定はできないのが現状のようです。
クイック出金であっても、「出金したい報酬金額は、任意で選択することができません。クイック出金の欄に表示されている金額全額が出金されます。」
https://crowdworks.secure.force.com/faq/articles/FAQ/10330/?l=ja&c=FAQ%3AC062&ct=%E5%A0%B1%E9%85%AC%EF%BC%88%E5%8F%97%E6%B3%A8%E8%80%85%EF%BC%89&cl=2&fs=Search&pn=1&id=kA010000000fyEF&url=10330


>この48,000円はどうなりますでしょうか。引き出せなくなるのでしょうか？

出金申請期限前にきちんと手続きをすれば、受け取れます。

よくある質問の「報酬の出金期限はありますか？」のページに以下のように書いてありますが
https://crowdworks.secure.force.com/faq/articles/FAQ/10367/?l=ja&c=FAQ%3AC062&ct=%E5%A0%B1%E9%85%AC%EF%BC%88%E5%8F%97%E6%B3%A8%E8%80%85%EF%BC%89&cl=2&fs=Search&pn=1&id=kA010000000XqpO&url=10367

>申請の期限は、未出金一覧の「報酬支払い確定日」項目に記載されている日付の23:59までに、下記のいずれかの方法で申請を行っていただきますようお願いいたします。
■随時出金方式（初期設定）に設定する※
■クイック出金を利用する

※実際は「出金申請期限」の日よりも前の「締め日」（15日と月末）までに、出金方式を50,000円以上出金方式などのオプションから随時出金方式（標準設定）に変更する必要があります。