クライアント側の源泉徴収について

大まかにいうと、収入を全部合算して、税金を計算します。
その計算して税金のうち、源泉徴収されている分を差し引いたものが、実際に追加で支払う（もしくは戻ってくる）金額ということになります。

わからないことがあれば税務署に聞きましょう。

>クライアント側が源泉徴収している・していないも含めて収入は合算した計算でしょうか。
そうです。
源泉徴収しているものも、源泉徴収前の金額で合算します。

>だとすると、クライアントに源泉徴収されているという事は損をしているということになるのでしょうか。
なりません。
源泉徴収ですでに徴収してある分を申請して、その分払う税金が少なくなります。

よくわからないのであれば、最初ぐらいは税理士使ったほうがいいですよ。