ドット絵制作の見積もりについて

グラフィックデザイン経験のあるプログラマーに過ぎませんが参考までに回答致します。

最近ではドット絵の制作工程もひとつではなくなったので一概に言えませんが、少なくとも品質によって費用、工数は大きく異なります。
また、同じキャラの同じ向きで異なるアニメーションパターンを描くときに、描き直さなければならない部位が腕と足だけであれば、パーツを分けることで工数削減できます。例えば歩くアニメーションであれば一日一人あたり数十～百枚で制作できると思います。
攻撃アニメーションなどでほぼ全体的に描き直さなければならないアニメーションであれば当然工数がかかります。３Dモデルなどであらかじめどのようなポーズとなるか擦り合わせできればいいのですが、曖昧な指示だった場合何度か手直しが発生するので実質一日一人あたり１アニメぐらいになったりします。既に１キャラ分完成しているアニメで他のキャラの分を制作するのであれば５～１０キャラ程度制作できるでしょう。

どのぐらいの予算でお考えかわかりませんが、少人数で制作するのであれば枚数がかなり多いのでデフォルメした３Dモデルをモーション付けし、遠近法をOFFでトゥーンレンダリングしたものをキャプチャして48*48に縮小後、アニメーションテストをして気になる部分だけ手直しする工程が現実的かと思います。その場合は３Dモデルの素体が数体（男、女、人外など）、髪も含め装備品とみなして装備品モデルが武器５０＋盾５０＋髪、角などが必要です。最終的に48*48になってしまうのでモデルのディティールにこだわる必要はありません。初心者レベルのモデリング技術でも十分です。

モーションはモデルのボーンが一致していれば全キャラ共通で使えるのでキャラクターのアニメーションパターン数２０と同一数になるかと思います。向きはカメラの位置を変えるだけで済みます。
モデルとモーションの用意ができていれば手直し以外定型作業になりますので一日一人あたり数百枚制作できると思います。

あとは担当する方の一日当たりの報酬次第です。３Dを使った定型作業であれば、作業手順を説明すれば手直し以外PC操作できる人なら誰でもできるので一日1万円前後でしょうか。全て独立して作業を行ってもらう場合は一日1万5千円～2万ぐらいになると思います。その場合少し工数に曖昧な部分が出てくるのであらかじめ予算と完了すべきタスクを明示しておいたほうがいいでしょう。